办公室主要部门及相关职责：

秘书处（督查室、值班室、应急办公室）：主要负责综合协调、督查督办、值班管理等工作。

综合与法规处（新闻办公室）：主要负责领导文稿起草、文稿审核、新闻宣传和有关法规工作等。

机要保密处：主要负责机要文件管理、保密管理、档案管理、印章管理等工作。

科研处（智库联络办公室、中心学术委员会秘书处）：主要负责科研管理、智库联络、中心学术委员会等。

财务处：主要负责预算决算、财务管理和报销等工作。

战略研究部主要工作职责：

研究中国经济发展的长期趋势；经济发展阶段演进的一般规律和发展战略问题；经济结构调整；

经济增长方式和发展模式；中国经济与世界经济发展的互动关系；中国中长期发展中的其他重要问题。

经济研究部主要工作职责：

中国区域经济发展格局的中长期变动趋势；中国城市化发展战略；国内区域经济合作；宏观经济形势与区域经济运行的关系；宏观经济政策对区域经济发展的影响；区域竞争力的分析、评价与比较；欠发达地区、特定区域的发展战略、规划和政策设计；跨国区域合作对国内区域经济发展的影响；区域发展战略和政策的国际比较。

产业规划部主要工作职责：

研究产业结构、产业组织、产业布局、产业政策、产业竞争力等问题；研究政府监管体制问题；研究促进产业结构优化的投资结构和投资政策；研究国民经济各产业的相互关系及其协调发展问题，提出综合性的对策建议。

对外交流部主要工作职责：

智库设立对外交流部作为智库的活动事务管理部门和国际化工作专门职能部门，起草制定合作与交流规划与政策、协调与管理相关事务的职能部门和办事机构，全面负责智库的日常活动及国际化战略实施工作。

乡村振兴研究所主要工作职责：

综合研究中国城乡协调发展、农村经济体制变革、农业和农村经济结构调整、农村经济和社会管理等农村改革和发展问题。重点研究领域有：农村经济运行与政策实施效果评估；农产品供求和农村市场变化、农产品对外贸易、农民收入与消费状况；农村金融和农村公共财政体制改革；农业基础设施建设、生态环境建设、农业科技进步。重视农村实地调查、重视跨部门合作、重视国际交流与合作研究，研究成果及政策建议具有前瞻性，又具备现实可操作性。

创新发展研究所主要工作职责：

综合研究我国创新发展的战略、制度与政策，研究国家和区域创新体系建设、体制机制和战略，研究高新技术产业发展、传统产业升级、创业和新业态培育的战略与政策，分析创新在经济发展和转型中的作用，开展创新政策评估和重大项目论证，对相关规划与政策的制定提出咨询建议。